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阿瑞斯曾怀疑过这艘古代飞船还能不能用。看来那些把它赠给亚特兰蒂斯人的古代人是把它设计成能永久使用的。阿瑞斯不知道那个把它提供给他的化身是不是多年以前就知道会发生这种事情，多多少少为此做了准备。
自从大流亡以后，阿瑞斯再也没见过那个化身。当时他谴责阿瑞斯的行为，说那是严重的背叛。阿瑞斯一直以来都无视了他的话，为了拯救自己的同胞们一个劲地推进着自己的计划。现在这个计划适得其反。他的世界毁灭了，他对此有一部分责任。这个念头在他心中萦绕不去。
他在沉思中沿着黑暗的金属走廊走去，步伐沉重。他重新回忆起和那个化身的对话，这时其中的几句跳了出来。
“我们让我们的社会分裂了。在你们的时代，剩下的只有衔尾蛇军。”阿瑞斯知道，他的同胞们重复了同样的错误。亚特兰蒂斯人的社会也分裂了。但阿瑞斯做出了补偿措施：反蛇法令。他走进复活舱，里面成千上万的管子一直延伸到黑暗深处。阿瑞斯停在装着莱克斯的管子前，这个叛乱者的眼神坚定，可阿瑞斯很快就会知道他心中的秘密了。复活过程捕获了他的记忆，阿瑞斯能直接看到里面的内容。
阿瑞斯来到一间适应性研究实验室，走进大玻璃缸里明亮的黄色灯光中，开始观看快速闪过的莱克斯的记忆。
他看到莱克斯乘上流放舰队中的一艘飞船，离开了亚特兰蒂斯母星，飞往殖民世界。在那里他和他的人民安顿下来，建起一个卑微然而稳健的社会，以农业和体力劳动为核心。过了几年，殖民地有所成长之后，人们选出了领导人。莱克斯成为了他的人民的一个领袖。
阿瑞斯看着他在某天偷偷溜进了山区。一艘登陆舰，一艘亚特兰蒂斯人的科学考察飞船在那里等他。一个女科学家站在飞船前面，阿瑞斯认出了她：伊西斯。
阿瑞斯看着他们进行交谈，然后莱克斯拿走了那个容器。把它布置好之后，莱克斯溜进了复活艇中的管子里，然后时间飞逝，虽然定期会被打断。
流放者的若干领导形成了一个小圈子，只有其中的人才知道加速进化的真相。他们会定期向莱克斯通报进展。过去曾是些小居民点的地方出现了村子，然后变成了小镇，城市，最终化为了向外四处扩张的大都市，足以和亚特兰蒂斯母星上的大都市匹敌。
在阿瑞斯眼中，这个文明的进程就像是延时摄影中的一株绿色植物，迅速生长，然后绽放出一朵绮丽绚烂的花朵。
在下一段记忆中，莱克斯从复活艇中的管子里冲了出去，越过外面的岩地，跑到了山边。在那里他看到一些闪光的炽热物体划过天空，坠入城市。灰烬和火焰覆盖了整个地平线。
阿瑞斯知道这场屠杀要部分归咎于他——尽管他很不愿意承认这点。在大流亡之后的年代里，他给哨兵无人飞船编制了程序，让它们去攻击任何发达到越过了一个阈值，而又不含有纯净的亚特兰蒂斯基因的种族。伊西斯并不是第一个分离出这种让亚特兰蒂斯人在遗传上独一无二的东西的人；在大流亡之后那些年里，科学研究团队从无数的人科生物身上采集了样本，分离出了控制亚特兰蒂斯人进化的那些基因。阿瑞斯则利用这一遗传蓝图来辨识潜在的敌人。
这个计划在他心中形成的同一刻那个化身就对阿瑞斯发出了警告，并把这称之为背叛。但当时阿瑞斯认为这是正当的，这不过是个保障生存的方式。任何发达文明对于亚特兰蒂斯人都可能成为威胁。他们离开自己的星球外出后有可能打破哨兵防线，就像当年亚特兰蒂斯人所做的那样；还可能更糟，他们有可能直接攻击新亚特兰蒂斯星。他们还可能重复衔尾蛇们的错误，让他们的科技统治他们，掌控他们的文明。在新哨兵防线内部只有一个发达种族存在的空间。阿瑞斯让哨兵飞船们去消灭任何脱颖而出的没有亚特兰蒂斯基因的种族——任何一个非亚特兰蒂斯人的发达文明。
阿瑞斯在莱克斯的记忆中看着那些哨兵飞船执行了预设的指令，向流放者们的世界进行轨道动能轰炸。和之前的许多次一样，它们摧毁了城市，改变了行星的气候。变化后的环境毫无疑问将会杀死所有幸存者。
但莱克斯的记忆显示，那些流放者为了在那个已成废墟的世界上生存奋力拼搏。伊西斯帮助创造出的这个民族适应能力很强，而且意志坚定。他们撤到了地下，建起了向下发展的城市，其复杂程度和之前摩天接云的大都会不相上下。伊西斯的基因疗法创造出了一个拥有无限智慧的民族。而且他们还拥有某种更危险得多的东西：永不屈服的求生欲。他们克服了一个又一个挑战。他们复制了亚特兰蒂斯的复活技术，他们的领导们利用这一技术跳过漫长的时光，准备逃离他们的废土世界。他们成功了。千万艘飞船从地表下蜂拥而出，淹没了那些出现在附近空间的哨兵飞船，在战斗中获胜后就跃迁离开了。
哨兵们一直在永不停歇地追击他们，流放者和哨兵之间的战争时而激烈，时而平息，延续了几千年。流放者们的舰队最终让战局发生了足够的转变，得以朝着亚特兰蒂斯人的母星进行一次决死突袭，希望能迫使那些之前迫害他们的人召回那些多年来一直折磨、杀害他们的哨兵。
阿瑞斯望着莱克斯把他的三角形飞船停在收容方舟的古老圣殿旁。在那里他和他的士兵们发现了阿瑞斯。两人的记忆在此交会。
阿瑞斯走出那个黄色玻璃缸。他的世界的毁灭，这一罪孽只有一部分在他。剩下的要怪伊西斯犯下的错误，而且她是扭转局面的关键。
阿瑞斯走到装着复活管子的船舱前，伫立在大门口。真是讽刺：亚特兰蒂斯人为了自我保护采取的冷酷政策最终制造出了一个给他们带来毁灭的敌人。而在变成一个和平的高度发达文明的途中，他们本身居然已经变成了一个心理上毫无反击能力的民族。
即便他的同胞们还可以被治愈，阿瑞斯也不知道他该怎么做。但他有更重要的事情要先去完成。流放者的舰队战力强大，而且还在增长。很快他们就会击溃哨兵，然后寻找方舟。时间有限。而且一旦哨兵飞船被消灭，衔尾蛇军就会涌入哨兵防线中，把流放者和亚特兰蒂斯人一同抹去。
他的选择很有限。他需要一种新的武器，一种能给敌人致命一击的技术。
伊西斯——她是关键。
CHAPTER 47
凯特在黄色的玻璃缸中瞪大眼睛，站稳脚步，准备最后一次奔赴伊西斯的过去。下面的记忆将会揭示出亚特兰蒂斯人在地球上究竟做了些什么。她希望它同时也会揭示出阻止阿瑞斯的关键。
自从那个悲惨的消息从家乡传来之后，伊西斯只觉得时间爬行得像蜗牛一样。每次她和雅努斯从管子中醒来时，都期盼着能有一点新的消息，然而总也没有。唯一能让他们感到时间还在前进的只有来自那些人科生物的观测数据：他们当初来这里就是来研究它们的。初始的小群生物在世界各地扩展，兴起，适应环境，濒临绝灭，然后又复兴，这样的剧目他们已经看过无数次了。他们的日志记录下了发展过程，而他们渐渐回到了他们所知的唯一的日常生活中：分析数据，设计新的实验，以及定期外出进行实验。雅努斯在实验中保持着超然、冷漠的态度，他只有面对伊西斯的时候才会流露出感情。可即便在如今的处境下，伊西斯也没有回应他。但她正在改变，变得对这颗行星上的新生物种们越来越关心。也许是因为在亚特兰蒂斯母星上的那些戏剧性经历，也许是因为和莱克斯在一起的那些时光，总之她内心深处有些东西发生了松动，她的情感正不可抑制地发生剧变，但从外表上完全看不出来。她全身心扑在科学研究上，熬着日子，希望能有新的消息来。
在中央大陆上演化出了一群新的人科生物，他们给这些家伙分配了一个新的记录编号：亚种8472。他们突飞猛进，发展出了很不错的工具制造技术以及语言交流能力。
“他们很有看头。”雅努斯说。
“我同意。”
和其他亚种一样，他们对这个新亚种进行了标记，每次她和雅努斯从休眠周期中苏醒时都会检查他们的人口水平。
一阵警报声惊醒了他们。伊西斯迅速找到了报警原因：在邻近这颗行星赤道附近的一个小岛上，一座超级火山爆发了，将大量的火山灰喷发到大气中，导致好几块大陆上的气温都降低了。火山冬天让这个新亚种的数量大为减少，他们已经处于灭绝边缘。
伊西斯在外出的最后两个幸存者身上采集样本的时候，做出了一个决定命运的抉择。在山洞里，注视着那两个幸存者时，她再也无法坐视他们死去。她能拯救他们。就她所知，在新哨兵防线内部可能已经有许多个世界遭到攻击，数百种人类遭到灭绝，对亚特兰蒂斯人的母星进行的攻击只是这一系列攻击之一。她不会坐看这个亚种走向灭绝，在她的研究能拯救他们时尤其不会。
她把幸存者们带回到阿尔法号登陆舰上，将她用在流放者们身上的亚特兰蒂斯基因疗法略加调整后用在了他们身上。
她转过身时发现雅努斯来到了研究实验室中。
“你在干什么？”
“我在……进行一次实验。”
“什么类型的实验？”
“调整几个控制大脑神经连接的基因。我认为我可以增大他们生存的机会。这是我的研究——”
“你不可以这样。”
“我们必须这样。”伊西斯说，“我们这一物种可能只有这里还剩下些了。我们不能眼睁睁看着他们走向灭绝。”
雅努斯一直表示反对，但最终同意了——在对实验进行紧密监察的前提下。
接下来的几次休眠周期安然无事。伊西斯和雅努斯观察着这个亚种的人口反弹